Ludvig Müller var en dansk numismatiker, dvs. møntkender.
Müller blev inspektør ved Den Kongelige Mønt- og Medaillesamling i 1841, direktør fra 1865. Fra 1848 var han tillige inspektør ved Thorvaldsens Museum og fra 1866 leder af Nationalmuseets Antiksamlingen.
Müllers bog om Alexander den Stores møntvæsen (1855) og trebindsværket om Nordafrikas mønthistorie i oldtiden (1860-1862 med supplement 1874) blev udgivet på fransk og sikrede Müller og dermed Den Kongelige Mønt- og Medaillesamling i København en fremtrædende international placering.
Ludvig Müller var bror til Adam Müller, far til P.E. Müller og Sophus Müller.