鹿鸣庵的历史当追溯到600年前。内存大清光绪年间制作的庵碑碑文说：“粤自大汉永平八年（公元65年），我佛如来倡教东土，是由建寺（指妙高）崇祀，历唐宋元明而香火不衰……又号鹿鸣庵者，邑民申家福也。家福夫妇年老无子并远门近亲无可继之人，因投固陵南乡妙高寺为僧，其居一室改为庙宇，即将所有亩产入庙，作香火之资，而徒子法孙日聚焉……”按碑文推算，大清道光六年（公元1827年）以前，“由家福以迄于今相传近十代”，申氏夫妇入寺入庵大约在公元1400年前后。自此，开创了僧尼合寺的佛门新篇。